Область располагает многочисленными озерами и густой речной сетью (в среднем 0,53 км/км2).

Все реки (кроме Илексы) относятся к бассейну Северного Ледовитого океана.

В период весеннего половодья реки сбрасывают до 50-65% годового стока, а в межень сильно мелеют.

Крупные реки: Северная Двина, Печора, Вага, Пинега, Онега, Мезень.

В области около 2,5 тыс. озер, от малых до относительно крупных (более 50 км2) - Лача, Кожозеро, Кенозеро, Лекшмозеро, Ундозеро.

Имеется выход в открытый океан через слабо замерзающее Белое и незамерзающее Баренцево моря. Прибрежные части морей мелководны, с многочисленными мелями.

Объем сточных вод, поступивших в водные объекты области в 2001 г., составил 794,6 млн. м³, из которых 68% - загрязненные сточные воды.

Наибольшие сбросы загрязненных сточных вод производят: ОАО "Котласский ЦБК" - 212,76 млн. м³ (40% областного объема сброса), ОАО "Архангельский ЦБК" - 108,01 млн. м³ (20%), ОАО "Соломбальский ЦБК" - 68,74 млн. м³ (13%). Из 80,7 млн. м³ загрязненных сточных вод, сбрасываемых в г. Архангельск, на долю городского ЖКХ приходится только 6,3 млн. м³, или около 8%.

Для Северной Двины характерны следующие загрязняющие вещества: соединения железа и меди, органические вещества, лигносульфонаты, на отдельных участках - фенолы и нефтепродукты.

Наиболее загрязненными диоксинами признаны донные осадки рек бассейна Северной Двины на участках: р. Вычегда от г. Сыктывкар до г. Котлас; система рек Пукса - Мехреньга - Емца; приустьевая часть р. Северная Двина.

В донных осадках р. Северная Двина, например, вблизи мест выпуска сточных вод ОАО "Архангельский ЦБК" содержание диоксинов (ПХДД/ПХДФ) в диоксиновом эквиваленте составляло 0,41-15,44 мг/кг; вблизи выпуска стоков ОАО "Котласский ЦБК" 0,83-1,59 мг/кг; в черте г. Архангельск 0,17-5,34 кг/кг. Фоновое загрязнение полихлорированными диоксинами и фуранами (ПХДД/ПХДФ) донных осадков бассейна р. Северная Двина оценено на уровне 0,09-0,20 мг/кг. Концентрация ПХДД/ПХДФ в диоксиновом эквиваленте в почвах свалок и на территории некоторых предприятий варьировала в диапазоне от 0,4 до 76,7 мг/кг.

В области разведано 16 месторождений пресных подземных вод. Запасы по ним суммарно составляют около 950 тыс. м³/сут.

Подземные воды забираются в 1360 скважинах, в том числе в 79 скважинах на групповых водозаборах. Большая часть скважин располагается в пределах Северо-Двинского артезианского бассейна (93,6%).

На территории области разведано 8 месторождений минеральных вод. Разведанные эксплуатационные запасы составляют 21,25 тыс. м³/сут, из них подготовлены для промышленного освоения 2,57 тыс. м³/сут.

Минеральные (лечебные) воды достаточно разнообразны по химическому составу и минерализации. Наиболее распространены - бромные, йодно-бромные, железистые, без специфических компонентов.

Воздействие на окружающую среду в 2004 г.
Водопотребление и водоотведение
Показатель			млн. м3	Основные источники загрязнения водных объектов (млн. м3) ОАО “Котласский ЦБК”, пос. Коряжма (171,84) ОАО “Архангельский ЦБК”, г. Новодвинск (138,16) ОАО “Соломбальский ЦБК”, г. Архангельск (63,77) ГУП “ПО “Севмашпредприятие”, г. Северодвинск (23,34)
Использовано воды, всего			626,14
Объем оборотной и повторно-последовательно используемой воды			821,87
Экономия свежей воды, %			59
Сброшено в поверхностные водоемы			649,65
в том числе:
загрязненных сточных вод			454,17
из них без очистки			68,72
нормативно чистых			175,1
нормативно очищенных			20,38
Доля загрязненных сточных вод в суммарном сбросе сточных вод в водные объекты, %