В 2002 г. в области использовано на производственные, хозяйственно-бытовые и другие нужды 1787,1 млн. м³ воды. В поверхностные водные объекты сброшено 1397,4 млн. м³ сточных вод, в том числе: загрязненных - 630,0 млн. м³, нормативно очищенных - 42,8 млн. м³. Сброс загрязненных сточных вод увеличился на 11,5 млн. м³. Очистные сооружения не обеспечивают очистку сточных вод из-за перегрузки, неудовлетворительной эксплуатации, морального и физического износа. Основными источниками загрязнения водных объектов являются объекты ЖКХ, крупнейший из них - ОАО "Экоаэросталкер", г. Щелково (74,06 млн. м³). Кроме того, вклад в загрязнение водоемов вносят водопроводно-канализационные предприятия городов Подольск, Орехово-Зуево, Серпухов, Коломна, Павловский Посад.

Дефицит чистой воды в городах Московской области обусловлен не столько ограниченностью водных ресурсов, сколько несоответствием их качества санитарно-гигиеническим требованиям. Основной проблемой использования ресурсов подземных вод является не их нехватка, а неупорядоченное водопользование. В критическом состоянии находятся малые реки области: не соблюдается режим использования водоохранных зон и прибрежных полос. Существует опасность увеличения зон загрязнения подземных вод, которые служат основным источником водоснабжения Московской области.