Основная отрасль экономики Агинского Бурятского автономного округа - сельское хозяйство, которое и является главным потребителем воды. В 2002 г. общий объем забора воды составил 5,53 млн. м³ пресной воды, в том числе: поверхностных вод - 1,22 млн. м³, подземных вод - 4,31 млн. м³. Использовано на производственные нужды 0,49 млн. м³ воды, орошение - 0,021 млн. м³, сельскохозяйственное водоснабжение - 2,21 млн. м³, в системах оборотного водоснабжения - 0,41 млн. м³. Потери воды составили 0,12 млн. м³, передано - 0,31 млн. м³.

Общий объем сброса сточных вод составил 0,833 млн. м³, из них: в поверхностные водные объекты - 0,028 млн. м³, в пруды-накопители, поля орошения, фильтрации, на рельеф местности - 0,583 млн. м³, в пруд-накопитель для сточных вод, прошедших биологическую очистку, - 0,222 млн. м³.

Качество воды в системе централизованного водоснабжения улучшилось в сравнении с предыдущим годом по микробиологическим показателям на 7,3%. В округе 94% населения для хозяйственно-питьевых нужд используют воду из артезианских скважин. Всего насчитывается 554 артезианских скважины, из них в сельских поселениях 483 скважины (87,2%). Не отвечает санитарным нормам и правилам 9,2% источников децентрализованного водоснабжения, в том числе из-за отсутствия зон санитарной охраны.