В поверхностные водные объекты сброшено 587, 6 млн. м³ сточных вод (на 8,7 млн. м³ меньше, чем в 2001 г.), в том числе: загрязненных - 426,1 млн. м³ (меньше на 21 млн. м³). Со сточными водами сброшено 801,7 тыс. т загрязняющих веществ. Вклад жилищно-коммунального хозяйства в общий сброс загрязняющих веществ в водные объекты составил, как и в 2001 г., около 10%. Загрязнение водоемов связано с неэффективной работой очистных сооружений. Основными причинами являются устаревшая технология очистки, большая изношенность сооружений, сброс в канализацию неутилизированных отходов, эксплуатация сооружений с отступлением от проектных схем, а также аварийные сбросы.

Наибольшую экологическую нагрузку на водные объекты оказывают промышленные и коммунальные предприятия городов Уфа, Стерлитамак и Салават, на долю которых приходится около 75% объема сброса сточных вод в республике и примерно 90% сбрасываемых с ними загрязняющих веществ.