Основными загрязнителями окружающей среды являются предприятия электроэнергетики, цветной металлургии, химической и горнорудной промышленности, котельные и отопительные системы частного жилого сектора, а также автомобильный транспорт. Остаются проблемными вопросы утилизации и размещения отходов производства и потребления. Не снижается негативное техногенное воздействие на природную среду, особенно в Абакано-Черногорском промышленном районе, где отмечен высокий уровень загрязнения атмосферного воздуха; подземные воды загрязнены нефтепродуктами.

В 2002 г. предприятиями выброшено в атмосферный воздух от стационарных источников 90,1 тыс. т загрязняющих веществ (на 6,2 тыс. т меньше, чем в 2001 г.). Степень улавливания загрязняющих веществ - 65,3% объема веществ, отходящих от стационарных источников, - на уровне среднего по России (74,5%). Крупнейший загрязнитель атмосферного воздуха - ОАО "Саянский алюминиевый завод" (22% объема выбросов по республике). В 2002 г. на предприятии снижены выбросы загрязняющих веществ на 15% по сравнению с 2001 г.